En un mundo que cambia rápidamente, donde las enfermedades emergentes y reemergentes plantean riesgos potenciales para la salud pública, la secuenciación genómica se ha identificado como una de las herramientas que ayuda en la identificación rápida de variantes preocupantes, el desarrollo de pruebas de diagnóstico y otras herramientas de gestión de brotes. La tecnología de secuenciación genómica es relativamente nueva en muchos países africanos, y su importancia se hizo más pronunciada en 2021 tras la circulación de las variantes preocupantes de COVID-19 (Delta, Alfa y Beta).
El 8 de febrero de 2021, Liberia envió su primer lote de 20 muestras de COVID-19 al Instituto Conmemorativo de Investigación Médica Noguchi (NMIMR) en Accra, Ghana, para su secuenciación. Los resultados publicados revelaron la presencia de la variante Alpha. Los lotes posteriores de muestras secuenciadas indicaron la presencia de la variante Delta, que se vinculó con el aumento de casos de COVID-19 y la gravedad de la enfermedad entre mayo y julio de 2021, mientras que el aumento de casos en 2022 se debió a la variante Omicron que también se detectó. Sin embargo, el tiempo de entrega de los resultados a menudo tomaba hasta 12 semanas, lo que obstaculizó los esfuerzos oportunos de vigilancia y toma de decisiones durante la respuesta a la pandemia. Esto llevó al Ministerio de Salud a solicitar el apoyo de la Organización Mundial de la Salud (OMS) y sus socios para desarrollar la capacidad nacional para la secuenciación genómica.
Inicialmente, la OMS apoyó la capacitación del personal del Laboratorio Nacional de Referencia, brindándole las habilidades necesarias para realizar la secuenciación genómica, incluido el análisis bioinformático. Con el apoyo de USAID, la OMS proporcionó equipo, infraestructura y suministros consumibles esenciales, incluida la instalación de una computadora de alta tetra, un servidor de datos en las instalaciones, un sistema de banco de energía, una fuente de alimentación ininterrumpida (UPS) y una máquina de secuenciación, reactivos y consumibles. Se estableció la plataforma de secuenciación y se reforzaron las medidas de seguridad con puertas y ventanas mejoradas. «Consideramos a la OMS nuestra unidad principal para la salud. Los miembros de nuestro equipo recibieron capacitación en bioinformática y secuenciación genómica en Ghana, Nigeria y Gambia. Como un centro que brinda servicios a todas las instalaciones de salud en Liberia, incluidas las instalaciones privadas, nos complace que con la llegada de estas sofisticadas máquinas, podemos realizar nuestras pruebas en el país y los resultados estarán disponibles en el menor tiempo posible en comparación con el pasado», dijo el Sr. Aaron T. Momolu, Técnico de Laboratorio para Diagnósticos de Calidad en el Laboratorio Nacional de Referencia.
El líder del equipo de WHE para la OMS en Liberia, el Dr. Julius Monday, cree que este es un paso en la dirección correcta para combatir pandemias y epidemias.“Mejorar la vigilancia a través de una secuenciación genómica de patógenos fortalecida que está integrada en la arquitectura de salud pública más amplia, mejorará la efectividad de la Vigilancia y Respuesta Integrada de Enfermedades (IDSR) de Liberia en línea con la Transformación de los Sistemas Africanos de Vigilancia y la Estrategia Global de Vigilancia Genómica para patógenos con pandemia y epidemia iniciativas potenciales para 2022-2032″, declaró el Dr. Lunes.
Con las instalaciones recién establecidas, Liberia no solo obtuvo la capacidad de realizar la secuenciación genómica del virus SARS-CoV-2, sino que también amplió sus capacidades para otras enfermedades epidémicas y pandémicas como la influenza, la fiebre de Lassa, la viruela M, el sarampión, y la enfermedad por el virus del Ébola. Esta capacidad de secuenciación más amplia tiene un enorme potencial para mejorar la vigilancia y la respuesta a la enfermedad en el país.
Durante la ceremonia de entrega de los equipos y suministros de secuenciación, el Dr. Clement Peter, representante de la OMS en Liberia, expresó su satisfacción por hacer esta importante contribución al país. «Con estas inversiones, Liberia ahora se une a otros países africanos que realizan secuenciación genómica en la región para permitir la detección y respuesta efectivas a las variantes del SARS-CoV-2 y otras enfermedades epidémicas y pandémicas, lo que mejorará en gran medida la calidad y la eficacia de la vigilancia de enfermedades. en el país. La pandemia de COVID-19 ha resaltado la importancia de rastrear las variantes del virus para la salud pública. Si bien la OMS ha apoyado el establecimiento de la capacidad de secuenciación genómica en el país, es necesario considerar cómo mantenerla en caso de futuros brotes», dijo el Dr. Peter.
El establecimiento de la capacidad de secuenciación genómica en el país transformará la respuesta de Liberia al COVID-19 y otras enfermedades prioritarias al vincular los datos de secuenciación genómica con la vigilancia y el manejo de casos para medidas de respuesta oportunas y apropiadas. Además, los beneficios a largo plazo se extienden a oportunidades como el desarrollo de vacunas.
Expresando su entusiasmo, la Dra. Jane A. MaCauley, directora general del Instituto Nacional de Salud Pública de Liberia (NPHIL), es optimista de que el apoyo elevará la toma de decisiones de Liberia sobre preparación y respuesta a amenazas para la salud pública. «Liberia agradece el apoyo de la OMS para establecer capacidades de secuenciación genómica tanto para COVID-19 como para otras enfermedades prioritarias, incluida la resistencia a los antimicrobianos, utilizando un enfoque de One Health. Las capacidades de servidor de datos y bioinformática creadas ayudarán a analizar e interpretar los datos de secuenciación para tomar decisiones oportunas. -hacer y acciones», dijo el Dr. MaCauley
A través de esfuerzos de colaboración, la OMS y USAID han empoderado a Liberia para superar los desafíos de la secuenciación genómica retrasada para COVID-19 y otras enfermedades infecciosas. La inversión en infraestructura, capacitación, equipos y suministros no solo ha fortalecido la capacidad de Liberia para la vigilancia genómica de variantes preocupantes de COVID-19, sino que también allanó el camino para mejorar la vigilancia de enfermedades prioritarias, la detección temprana de variantes emergentes preocupantes, lo que lleva a más intervenciones de salud pública efectivas.
La OMS se está asociando con países africanos para mejorar la vigilancia de patógenos a través de la secuenciación del genoma, con un total actual de 41 laboratorios establecidos. Este esfuerzo de colaboración tiene como objetivo detectar y responder de manera eficiente a las variantes de COVID-19. El viaje de Liberia sirve como un faro de esperanza, demostrando el impacto transformador de desarrollar la capacidad local frente a los desafíos de salud global.
